转自:北京日报客户端
利用自主建立的数学模型,北京雁栖湖应用数学研究院教授邬荣领团队联合多位合作者,提出个性化全基因组互作组网络模型,可利用数学方法直接“算”出植物基因所对应的性状变化。这项数学与林学的跨界合作,为植物精准育种提供了全新理论工具。近日,相关研究成果在《园艺研究》发表。
梅树的快长树(左)与慢长树(右)示意图要育成一种全新的树木品种,传统方法需要历经漫长的人工杂交和选育过程。由于树木生长缓慢,往往需要几代科研人员的努力,才能得到一个优秀的树种。探究植物复杂性状的遗传调控机制,是现代生物学的核心难题。“就像是建一栋大楼,需要考虑每块砖头的布局以及整体的结构设计。只有依托巧妙的统计学和数学理论,我们才能解析遗传物质这座‘大楼’中,基因之间的相互作用,从而实现植物性状的精准调控。”邬荣领解释。
邬荣领利用他20年前发明的功能作图方法,以及来到雁栖湖数学院后带领团队建立的统计物理学网络模型idopNetworks(爱豆网),实现了作物自身控制产量、抗病性、抗逆性等复杂性状的关键基因和基因间相互作用网络的准确定位、控制。“这套模型能解决复杂系统中的涌现现象,‘三个臭皮匠顶个诸葛亮’,看似普通的几个基因共同作用,能实现‘一加一大于二’的效果。”邬荣领说,这项成果用数学方法将基因对作物性状的影响“算”出来,推动数学理论走向实际应用。这将为作物构建起精准的“基因导航图”,帮助育种专家依据个体基因型,设计定制化的改良方案。
梅树成为这套精准育种模型的第一个“用户”。结合全基因组数据与株高地径表型数据,科研团队重点对比了快长树与慢长树的生长机制差异。快长树的基因网络中,正向促进作用占比达85%,形成了利于生长的调控体系;慢长树的生长关键基因受到其他基因网络的强烈抑制,从而表现不佳。模型预测,通过基因编辑技术敲除负调控因子后,被压制的优良基因就能被唤醒,让慢长树品种的生长水平实现反超。
该成果是个体水平基因动态互作图谱绘制的重大突破,不仅能够助力林业领域精准育种工作,还能推广至动物育种乃至人类精准医疗。“作为北京市支持建设的新型研发机构,雁栖湖数学院的目标是做原创性的研究。我可以很自信地说,这项原创成果只有我们做得出来。”邬荣领语气坚定,“它将重塑数量遗传学的理论体系,未来有望发展出一套属于中国的遗传研究方法。”
来源:北京日报客户端